Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms