Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms