Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc13Q3TIR1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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