Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtl9Q32KG4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms