Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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