Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VGLL4Q14135 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms