Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms