Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col17a1Q07563 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col17a1Q07563 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms