Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms