Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms