Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp1P98063 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp1P98063 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms