Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx2P81066 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx2P81066 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx2P81066 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms