Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Plxna3P70208 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms