Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps17P63276 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms