Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5bP56480 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5bP56480 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms