Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms