Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms