Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa10P31310 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa10P31310 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa10P31310 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa10P31310 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa10P31310 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa10P31310 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa10P31310 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa10P31310 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa10P31310 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa10P31310 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa10P31310 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms