Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18530 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18530 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18530 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18530 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18530 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18530 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18530 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18530 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18530 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18530 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18530 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18530 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P18530 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P18530 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18530 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18530 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18530 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18530 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18530 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18530 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms