Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P10404 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P10404 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P10404 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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