Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hcn3O88705 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn3O88705 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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