Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn20O55082 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms