Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BckdkO55028 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BckdkO55028 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BckdkO55028 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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