Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms