Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LctF8VPT3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LctF8VPT3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms