Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms