Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Gm10378F6XQQ1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Gm10378F6XQQ1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Gm10378F6XQQ1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gm10378F6XQQ1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gm10378F6XQQ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gm10378F6XQQ1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gm10378F6XQQ1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm10378F6XQQ1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Gm10378F6XQQ1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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