Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms