Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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BC035044E0CXF8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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BC035044E0CXF8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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