Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp26c1B2RXA7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms