Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apol7aB2RT54 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms