Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
1700042G07RikB1AUF7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms