Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms