Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Col5a3Q9JLI2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col5a3Q9JLI2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms