Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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