Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms