Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms