Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms