Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdca3Q99M54 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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