Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms