Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nlgn1Q99K10 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nlgn1Q99K10 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlgn1Q99K10 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms