Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A9Q96Q91 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms