Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi2Q920Q6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms