Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms