Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF2Q8IX21 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms