Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms