Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms