Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms