Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arhgap44Q5SSM3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms