Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav8d-2Q5R1B6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms